Orquestrador Declarativo de Diagramas & Gráficos Científicos
Transforme Markdown declarativo em PDFs acadêmicos e gráficos vetoriais estritamente formatados conforme a ABNT NBR 14724, com suporte a diagramas multi-engine (Kroki, Mermaid) e extensão para heredogramas clínicos.
Diagramas Declarativos (Kroki)
Suporte transparente a blocos Mermaid, PlantUML, Graphviz e Vega-Lite através da integração isolada com o gateway Kroki.
Tipografia Vetorial com Typst
Diagramação de alta velocidade com três perfis bibliográficos CSL integrados: trabalho-ufsc (capa institucional padronizada), abnt (NBR 14724) e vancouver (biomédico).
Hermeticidade e Padrão GOST
Ambiente conteinerizado multi-stage OCI rodando com usuário não privilegiado e suíte de testes com cobertura superior a 90%.
Extensão: Heredogramas Clínicos
Módulo especializado para geração de heredogramas no padrão NSGC via motor R (pedtools e kinship2) para publicações biomédicas e genéticas.
🧩 Motores e Módulos Disponíveis
Selecione um motor para ver a documentação exaustiva de parâmetros, opções repassadas aos motores nativos e múltiplos exemplos práticos prontos para uso:
pedtools Principal
Heredogramas clínicos modernos (pedsuite R) com auto-dimensionamento vertical proporcional às gerações, half-fill e legendas.
kinship2 Legado
Motor legado de heredogramas clínicos baseado em kinship2 para compatibilidade retroativa com notas existentes.
table
Tabelas com tipografia acadêmica estrita (padrão APA/ABNT com 3 réguas horizontais, alinhamento numérico e notas de rodapé).
openchemlib & openbabel
Renderização vetorial SVG de estruturas químicas 2D a partir de notação SMILES e arquivos MOL/SDF.
mermaid
Fluxogramas, sequências, classes, estados, gitgraph e gráficos de Gantt renderizados via Kroki em alta resolução.
d2
Linguagem moderna de diagramação declarativa para arquitetura de sistemas, topologias de rede e fluxos de dados.
plantuml
Diagramas UML clássicos e de engenharia de software (casos de uso, componentes, sequência e pacotes).
graphviz
Grafos direcionados e não-direcionados, autômatos finitos e redes de relacionamentos em linguagem DOT.
gist
Inclusão resiliente de scripts analíticos (R, Python, Julia, SQL) hospedados no repositório externo (Gist) com cache em memória.
🚀 Inicialização Rápida no Ambiente Local
O Joaju provê interfaces prontas para o fluxo de trabalho integrado com o cccp:
# 1. Iniciar servidor com recarga contínua (hot watcher):
cccp serve --dev
# ou: npm run dev
# 2. Executar demonstração com dados semeados (Exposição VDNKh):
cccp serve --demo
# ou: npm run demo
# 3. Executar suíte completa de testes unitários e de cobertura:
npm test
npm run test:coverage📚 Perfis Tipográficos Suportados (YAML Frontmatter)
Configure o comportamento visual e o padrão bibliográfico no cabeçalho da sua nota no Obsidian:
---
titulo: Elaboração de Heredograma Familiar e Análise Genético-Clínica
subtitulo: Estudo de Caso Ambulatorial e Herança Autossômica Recessiva
autor: Equipe de Genética Médica
instituicao: Universidade Federal de Santa Catarina
local: Florianópolis
ano: 2026
perfil: trabalho-ufsc # Opções: 'trabalho-ufsc', 'abnt' ou 'vancouver'
---Perfil (perfil:) |
Finalidade e Regras Tipográficas | Estilo de Citação / CSL | Variáveis Suportadas no YAML |
|---|---|---|---|
trabalho-ufsc |
Trabalhos acadêmicos e monografias da UFSC. Gera capa institucional padronizada, folha de rosto, margens oficiais (3cm/2cm) e paginação no canto superior direito a partir da folha 2. | trabalho-ufsc.csl (ABNT/UFSC) |
titulo, subtitulo, autor, instituicao, local, ano, fonte, tamanho |
abnt |
Artigos científicos gerais e relatórios técnicos. Segue rigorosamente a ABNT NBR 14724 com espaçamento 1.5, numeração progressiva de seções (NBR 6024) e referências alfabéticas autor-data. | abnt.csl (NBR 6023) |
titulo, subtitulo, autor, fonte, tamanho |
vancouver |
Artigos e comunicações nas áreas médica, biológica e da saúde. Citações numéricas sequenciais entre parênteses no texto e referências ordenadas por ordem de aparição conforme padrão ICMJE/NLM. | vancouver.csl (ICMJE) |
titulo, subtitulo, autor, fonte, tamanho |
📊 Sintaxe de Diagramas e Gráficos
Escreva fluxogramas, grafos, sequências e arquiteturas diretamente em blocos de código declarativos com controle fino de escala:
```mermaid
%% width=85% max-width=600pt
graph TD
A[Coleta de Dados / Amostragem] --> B[Processamento & Limpeza]
B --> C{Validação dos Dados}
C -->|Válido| D[Análise Estatística & Modelagem]
C -->|Inconsistente| E[Filtragem de Ruído / Descarte]
D --> F[Visualização & Relatório Final]
```🧬 Módulo Especializado: Heredogramas Clínicos
Escreva dados genealógicos tabulares simples diretamente em blocos de código com diretivas visuais:
```heredograma
%% layout.width=90% layout.max_width=550pt cex=0.85
id,pai,mae,sex,fenotipo,label
1,0,0,M,wt,I.1 (Avô)
2,0,0,F,wt,I.2 (Avó)
3,1,2,M,het,II.1 (Pai Portador)
4,0,0,F,wt,II.2 (Mãe Não-Afetada)
5,3,4,F,hom,III.1 (Probanda Afetada)
6,3,4,M,wt,III.2 (Irmão Hígido)
```📡 Referência da API Local
Sonda de integridade operacional retornando status: "ok", versão atual e tempo de atividade.
Renderização rápida de fragmentos declarativos (diagramas Mermaid ou heredogramas) devolvendo SVG vetorial para visualização interativa instantânea.
Pipeline completo de compilação: pré-processa diagramas, executa filtros Pandoc e compila o documento ABNT final em PDF vetorial de alta resolução.